L’esposizione zoologica è per gran parte dedicata ai vertebrati. Nelle prime vetrine sono illustrate le caratteristiche proprie di questo gruppo animale che, pur non essendo il più numeroso come numero di specie, è certamente il più conosciuto.
Già dalle prime vetrine è possibile percepire l’impostazione espositiva del museo che, negli ultimi anni, ha introdotto spazi sensoriali in grado di offrire al visitatore la possibilità di “toccare con mano” quanto esposto.
Seguendo il percorso espositivo attraverso un approccio sistematico si incontrano: i pesci con forme adattate ai diversi ambienti acquatici; gli anfibi, animali il cui sviluppo è caratterizzato da fasi a vita acquatica e da fasi a vita terrestre; i rettili, primi veri conquistatori della terra ferma; gli uccelli, tra i quali si possono osservare i volatori più grandi e più potenti, per arrivare infine alla sala dei mammiferi.
